Şuna odaklan: 
Konferans Görünümüne Geri Dön
Giriş

Moleküler Dinamik Simülasyon Çalışmalarının ABC’si

→ Europe/Istanbul
Zoom

Zoom
Açıklama

 

 

TÜBİTAK ULAKBİM ve İTÜ-UHEM iş birliği ile, 29-30 Eylül 2022 tarihinde düzenlenecek olan EuroCC@Türkiye Moleküler Dinamik Simülasyon Çalışmalarının ABC’si başlıklı çalıştayında aşağıda belirtilen konularda eğitim ve uygulamalar gerçekleştirilecektir:

  • MD Simülasyonları Teorik Bilgi
  • MD Simülasyon Yazılımları
  • Örnek Çalışma: Protein Hazırlanması
  • Örnek Çalışma: İlk Analiz/Olası hatalar
  • Örnek Çalışma: Protein Minimizasyonu/Dengelenmesi Sonuç analizi/Olası hatalar
  • Örnek Çalışma: MD Simülasyon Koşumu
  • Örnek Çalışma: MD Simülasyon Sonuçlarının Analizi

Ön Koşul: Temel Düzey Linux ve Protein Kimyası Bilgisi

NOT: 

* Katılımcılara çalıştay sonunda herhangi bir katılım belgesi veya sertifika verilmeyecektir.

*Komut dosyaları ve output dosya örneklerine aşağıda yer alan "materials" kısmından erişebilirsiniz.

Etkinlik videosunu izlemek için tıklayınız. 

 

EuroCC ve TRUBA Sosyal Medya Linkleri

Twitter:

https://twitter.com/EuroCC_Turkey

https://twitter.com/TrubaUlakbim

LinkedIN:

https://www.linkedin.com/company/eurocc-turkey

https://www.linkedin.com/company/truba

Aylin Sungur_Gun1.pdf
Aylin Sungur_Gun2.pdf
Bulent balta komut dosyalari.tar
İletişim
  • 29 Eylül Per
    • 09:30 → 10:20
      MD Simülasyonları Teorik Bilgi 50dk
      Konuşmacılar: Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 10:20 → 10:30
      Ara 10dk
    • 10:30 → 12:00
      MD Simülasyon Yazılımları 1g 30dk
      Konuşmacılar: Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 12:00 → 13:00
      Öğle Arası 1g
    • 13:00 → 14:30
      UHeM Tanıtımı 1g 30dk
      Konuşmacılar: Dr. Kadir Diri (İTÜ UHeM)
    • 14:30 → 16:00
      Örnek Çalışma:Protein Hazırlanması 1g 30dk
      Konuşmacılar: Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 16:00 → 17:15
      Örnek Çalışma: İlk Analiz/Olası hatalar 1g 15dk
      Konuşmacılar: Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi)
  • 30 Eylül Cum
    • 09:30 → 10:45
      Örnek Çalışma:Protein Minimizasyonu/Dengelenmesi Sonuç analizi/Olası hatalar 1g 15dk
      Konuşmacılar: Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi), Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 10:45 → 11:00
      Ara 15dk
    • 11:00 → 12:15
      Örnek Çalışma: MD Simülasyon Koşumu 1g 15dk
      Konuşmacılar: Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi), Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 12:15 → 13:30
      Öğle Arası 1g 15dk
    • 13:30 → 15:15
      Örnek Çalışma: MD Simülasyon Sonuçlarının Analizi 1g 45dk
      Konuşmacılar: Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi), Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi)
    • 15:15 → 15:30
      Ara 15dk
    • 15:30 → 17:00
      Soru-Cevap 1g 30dk
      Konuşmacılar: Dr. Bülent Balta (İstanbul Teknik Üniversitesi), Prof. Fethiye Aylin Sungur (İstanbul Teknik Üniversitesi)