Name: Yüksek Başarımlı Hesaplama Kümelerinde İş Akışı Yöneticisi Kullanma
Start: 2021-09-16T14:00:00+03:00
End: 2021-09-16T15:30:00+03:00
Location: Zoom

Yüksek Başarımlı Hesaplama Kümelerinde İş Akışı Yöneticisi Kullanma

Thursday, September 16, 2021 - 2:00 PM

Monday, September 13, 2021
Tuesday, September 14, 2021
Wednesday, September 15, 2021
Thursday, September 16, 2021
2:00 PM Yüksek Başarımlı Hesaplama Kümelerinde İş Akışı Yöneticisi Kullanma - Ogün Adebali (Sabancı Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi)
Yüksek Başarımlı Hesaplama Kümelerinde İş Akışı Yöneticisi Kullanma
- Ogün Adebali (Sabancı Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi)
2:00 PM - 2:20 PM
İş akışı yönetim sistemleri, tekrarlanabilir ve ölçeklenebilir veri analizleri gerçekleştirmek için kullanılan araçlardır. Ardışık hesaplama işleri, bir girdinin birden çok iş için kullanılması, işler arasındaki bağımlılıklar gönderilecek işler bütününün karmaşık bir ağa dönüşmesine neden olmaktadır. Bu karmaşık iş akışlarının takip edilmesi, tekrarlanması, değiştirilmesi zor bir hale gelebilmektedir. Ayrıca, YBH sistemlerinde istenilecek hesaplama kaynağının her bir iş için bağımsız talep edilmesi YBH kaynaklarının verimli kullanılmasını ve işlerin daha hızlı sonlandırılmasını sağlayacaktır. Bu konuşmada söz konusu karmaşık iş akışları ile kolayca başa çıkabilmek için tasarlanmış iş akışı yönetim sistemlerinin YBH kümelerine adapte edilmesinden ve bu kullanımın veri analizine nasıl tekrarlanabilir ve ölçeklendirilebilir boyut katacağından bahsedilecektir. ---------------------------------------------------------------------------------- Konuşmacı: Ogün Adebali, lisans derecesini Orta Doğu Teknik Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü’nden almış ve doktora çalışmalarını Tennessee Üniversitesi, Genom Bilimi ve Teknolojisi programı çerçevesinde sürdürmüş, evrimsel biyoenformatik alanında çalışmalar yapmıştır. Oak Ridge Ulusal Laboratuvarı’nda moleküler sinyal iletimi konusunda ve Kuzey Karolina Üniversitesi’nde DNA onarımı konusunda doktora sonrası çalışmalarını gerçekleştirmiştir. Dr. Adebali, 2018 yılından bu yana Sabancı Üniversitesi’nde Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyomühendislik Programı’nda öğretim üyesi olarak çalışmalarını sürdürmektedir. Dr. Adebali, hesaplamalı genomik, moleküler evrim, nadir hastalıklar, DNA hasarı ve onarımı konularında projeler yürütmektedir. 2018’de EMBO kurulum desteği almaya, 2020 yılında ise TÜBİTAK’ın Uluslararası Lider Araştırmacılar Programı çerçevesinde destek almaya hak kazanmıştır. 2019 yılında Bilim Akademisi Genç Bilim İnsanları Programı (BAGEP) Burs Ödülü‘ne layık görülmüştür
2:20 PM Snakemake ve Conda Kullanılarak Otomatik Veri Analizi
Snakemake ve Conda Kullanılarak Otomatik Veri Analizi
2:20 PM - 3:05 PM

Share this page

Direct link

Social networks

Calendaring